En la reserva podremos encontrar:
- Dos especies de monos, mono aullador y mono capuchino, entre otras 41 especies de mamíferos, como el cabeza de mate, cusumbo, guantas, guatuzas, ardillas, etc.
- Aproximadamente 152 especies de aves, dentro de las cuales tenemos 45 especies endémicas (nativas) de la región y 8 especies en peligro de extinción, tomando en cuenta que en toda la Región Tumbesina se encuentran 55 especies endémicas de aves.
- Variedad de anfibios y reptiles, entre estos la ranita endemica Colostethus machalilla, endémica de la región.
- Por ultimo una única y exuberante flora, en la que se incluye la paja toquilla con la cual se elaboran los famosos sombreros “Panama Hat”, la palma de tagua (Phytelephas aequatorialis), la vistosa caña guadua, higuerones de más de 25 metros, entre otros. En plantas se han encontrado niveles de endemismo de hasta 70%.